Des bactéries génétiquement modifiées pour traiter les calculs rénaux : une étude révèle une avancée dans les thérapies microbiennes

Les thérapies basées sur la manipulation du microbiome intestinal sont confrontées à la limitation de la colonisation régulière de l'intestin par des bactéries artificielles , une étape qui a maintenant été franchie avec une bactérie conçue pour traiter les calculs rénaux.

Des chercheurs de l'Université de Stanford (États-Unis) ont publié dans Science une étude dont les résultats constituent une étape prometteuse, bien qu'encore imparfaite, vers des thérapies microbiennes, indique la revue.

Lors d’essais sur des modèles animaux et d’essais préliminaires sur l’homme, des bactéries intestinales artificielles conçues pour traiter les calculs rénaux ont colonisé avec succès le microbiome intestinal.

Les recherches sur la manipulation du microbiome intestinal avec des bactéries génétiquement modifiées ont jusqu’à présent été prometteuses chez les animaux , mais échouent souvent en milieu clinique en raison d’une colonisation incohérente.

L’équipe s’est concentrée sur une bactérie intestinale commune, Phocaeicola vulgatus, qu’elle a conçue pour consommer du porphyrane, un nutriment dérivé des algues.

Dans des travaux précédents, l’équipe avait montré que l’ajustement des niveaux alimentaires d’un prébiotique porphyrane pouvait créer une niche contrôlable qui permet une colonisation stable et ajustable des bactéries et peut être inversée si nécessaire.

Le porphyrane est rarement utilisé par les microbes dans les populations occidentales, car seulement environ 2 % d’entre eux possèdent des bactéries dotées de cette capacité, créant ainsi une niche écologique largement inoccupée pour qu’une souche modifiée puisse prospérer sans concurrence .

L'équipe a créé une souche de P. vulgatus métabolisant les porphyranes pour dégrader l'oxalate, une cause de calculs rénaux récurrents . Dans des modèles animaux et un essai clinique de phase 1/2a chez des humains en bonne santé, les auteurs ont constaté que les bactéries intestinales modifiées peuvent coloniser l'intestin de manière sûre et efficace et produire des effets thérapeutiques en réduisant les taux d'oxalate.

Cependant, certains individus ont développé une colonisation persistante en raison de mutations génétiques, et des événements de transfert de gènes horizontaux importants ont compromis la fonction thérapeutique de la souche.

Bien que la méthode ait montré des signes précoces et modestes de réduction des niveaux d’oxalate, des défis subsistent, notamment la stabilité des souches, la biosécurité et la concurrence des microbes indigènes, notent les auteurs.